Vengono utilizzati i grafi G (diretto) e G' (inverso complementato) calcolati dalla sequenza S; l'esempio grafico di come avviene la creazione del grafo diretto è stato [mostrato in precedenza]. Per semplicità l'alfabeto e composto da tre soli caratteri e l'operazione di complemento è l'identità, quindi inverso complementato è equivalente a inverso. [I grafi G e G' risultanti] Nell'esempio è stata utilizzata l=5. Le diciture dir e inv stanno per diretto ed inverso, la computazione che segue è finalizzata ad individuare rispettivamente sequenze dirette ed inverse. Le frecce sopra le sequenze rappresentano un avvenuto riconoscimento di sottosequenza, diretta od inversa, di S, ad opera di G e G', ai quali vengono passati i caratteri nell'ordine indicato dalla freccia.  | |
